所謂配伍用藥，就是按照病情的不同需要和藥性的不同特點，適當地將兩種以上的藥物配合在一起應用。藥物配伍後，必然會產生複雜的變化，有的能增強藥效，有的能減低藥效，有的能抑制或消除藥物的毒性和副作用，也有的能使毒性增加和產生不良反應。
配伍用藥方法分為七種：
- 單行
單用一味藥來治療疾病。對病情比較單純的疾病，可選擇一味針對性較強、療效突出的藥物來治療。如獨參湯，單用人參濃煎，治療因大失血引起元氣虛脫的危重症候。
- 相須
兩種功效類似的藥物配合應用，可以起到協同作用，加強藥物的療效。如石膏與知母都能清熱瀉火，配合應用後能明顯增強療效。
- 相使
用一種藥物作為主藥，配合其他藥物來提高主藥的功效。如補氣利水的黃芪與利水健脾的茯苓配伍，茯苓能提高黃芪補氣利水的療效。
- 相畏
一種藥物的毒性或副作用，能被另一種藥物減輕或消除。如生半夏的毒性能被生薑減輕或消除，所以說生半夏「畏」生薑。
- 相殺
一種藥物能減輕或消除另一種藥物的毒性或副作用。如生薑能減輕或消除生半夏的毒性或副作用，所以說生薑「殺」生半夏的毒。
- 相惡
兩種藥物配合應用以後，一種藥可以減弱另一種藥物的藥效。如人參「惡」萊菔子，因萊菔子可減弱人參的補氣作用。
- 相反
兩種藥物配合應用後，可產生毒性反應或劇烈的副作用。如烏頭反半夏。
為了確保療效，安全用藥，避免毒副作用的發生，在使用中藥治病時，必須注意用藥禁忌，用藥禁忌主要包括配伍禁忌、妊娠禁忌和服藥禁忌三個方面。
配伍禁忌是指某些藥物應避免配合應用，以免降低、破壞藥效，或產生劇烈的毒副作用。前人有「十八反」和「十九畏」的記載。
孕婦生病時，用藥要特別小心，因為有些中藥雖然可以治病，但有損害胎兒的副作用；若隨便用藥，輕則動胎，重則滑胎，或是造成胎兒發育不良和畸形。因此，孕婦用藥，必須謹慎。一般來說，凡有大毒的藥、峻瀉藥、破血逐瘀藥、破氣藥，以及辛熱、芳香走竄等作用強的藥物都屬於妊娠用藥禁忌的範圍。